Τον Αβέρωφ διαδέχθηκε στην προεδρία της κοινότητας ο Κωνσταντίνος Σαλβάγος (1900-1901), από τη Χίο, ένας από τους ιδρυτές της Εθνικής Τράπεζας Αιγύπτου. Υπήρξε σημαντικός παράγοντας στον κόσμο του εμπορίου και σπουδαία προσωπικότητα στην κοσμοπολίτικη κοινωνία της Αλεξάνδρειας. Η θητεία του Σαλβάγου ήταν μικρή, γιατί πέθανε αιφνίδια στα 1901.
Τον Σαλβάγο διαδέχθηκε ένας ακόμη εξαίρετος ΄Ελληνας, ο Εμμανουήλ Μπενάκης (1901-1911), από τη Σύρο, βαμβακέμπορας και ιδρυτής της παγκοσμίου φήμης εταιρείας «Χωρέμης – Μπενάκης». Κατά την προεδρία του Μπενάκη τα γραφεία της Ε.Κ.Α. μεταφέρθηκαν στο ελληνικό τετράγωνο του «Chatby». Αυτό είναι που σήμερα ονομάζεται το «τελευταίο τετράγωνο» και όπου διατηρούνται μέχρι σήμερα τα γραφεία της Ε.Κ.Α. Η οικογένεια Σαλβάγου ξεκίνησε το κτίσιμο του ελληνικού τετραγώνου του «Chatby» εις μνήμην του Κωνσταντίνου Σαλβάγου. Το 1906 θεμελιώθηκε η «Σαλβάγειος Εμπορική σχολή», που ήταν το μεγάλο όραμα του Αβέρωφ.
Η Σαλβάγειος εξελίχθηκε σε εμπορικό κολέγιο και λειτούργησε μέχρι το 1972. Το 1907 η Ζερβουδάκειος σχολή συγχωνεύθηκε με το «Αβερώφειο γυμνάσιο αρρένων-θηλέων» και το εμπορικό τμήμα θηλέων. Δύο καινούριες σχολές ιδρύθηκαν επίσης, το «Ανώτερο Παρθεναγωγείο» και η σχολή «Κοπτικής και Ραπτικής». Το 1908 ο Μπενάκης ίδρυσε το «Μπενάκειο Κοινοτικό Συσσίτιο» για να εξυπηρετεί τις ανάγκες των απόρων της κοινότητας. Το 1909 ο Εμμανουήλ Μπενάκης και η γυναίκα του Βιργινία, ίδρυσαν το «Μπενάκειο Ορφανοτροφείο Θηλέων» ανεγείροντας μεγάλο κτήριο, το οποίο βρίσκεται στο ελληνικό τετράγωνο του «Chatby». Το ορφανοτροφείο έκλεισε το 1970. Απ’ το 1972 εκεί στεγάζεται το Ελληνικό Γενικό Προξενείο Αλεξάνδρειας.
Επί προεδρίας Μπενάκη επισκευάστηκε η Τοσιτσαία σχολή και το νοσοκομείο αναβαθμίστηκε για να συμπεριλάβει το οφθαλμολογικό, παθολογικό, τα τμήματα λοιμωδών νόσων και πρώτων βοηθειών καθώς και τη νοσοκομειακή σχολή. Ο Μπενάκης πρωτοστάτησε στην ενίσχυση του μακεδονικού αγώνα. Ο βασιλιάς Γεώργιος συνεχάρη και ευχαρίστησε την Ε.Κ.Α. για την συμβολή και συνδρομή της προς το ελληνικό έθνος. Οι Έλληνες της Αλεξάνδρειας με πολλούς τρόπους εκδήλωναν τη συμπαράστασή τους στα εθνικά θέματα, καθώς και τη βοήθειά τους σε θύματα σεισμών και κάθε είδους θεομηνιών.
Το 1911 ο Μπενάκης παραιτήθηκε απ’ την προεδρία και επανήλθε στην Ελλάδα για να αφοσιωθεί στην υπηρεσία της πατρίδας. Διετέλεσε υπουργός Γεωργίας και δήμαρχος Αθηναίων.
Ο Αντώνης Μπενάκης, γιος του Εμμανουήλ, ίδρυσε το Σώμα Ελλήνων Προσκόπων και το Σώμα Προσκόπων Αιγύπτου. Αργότερα εγκαταστάθηκε στην Αθήνα, όπου μετά το θάνατο του πατέρα του, δώρισε την οικογενειακή του βίλα στο ελληνικό κράτος. Εκεί τώρα στεγάζεται το Μουσείο Μπενάκη Αθηνών. Η Πηνελόπη, κόρη του Εμμανουήλ Μπενάκη, παντρεύτηκε τον δημοσιογράφο Στέφανο Δέλτα. Η Πηνελόπη Δέλτα είναι από τις διασημότερες συγγραφείς παιδικών και νεανικών βιβλίων.
Τον Μπενάκη διαδέχθηκε στην προεδρία της Ε.Κ.Α. ο Μικές Συναδινός (1911-1919), από τη Χίο, και ο οποίος ήταν εξαιρετικά δημοφιλής στην παροικία. Ο Συναδινός ήταν ένας απ’ τους ιδρυτές της Εληνικής Φιλαρμονικής Ορχήστρας. Διετέλεσε και πρόεδρος του «Mohammed Ali Club», το οποίο έπαιξε σημαντικό ρόλο στην κοσμοπολίτικη αλεξανδρινή κοινωνία. Η Ε.Κ.Α., υπό την προεδρία του, απέστειλε βοήθεια στο ελληνικό στράτευμα, τόσο στους Βαλκανικούς πολέμους, όσο και στον Πρώτο Παγκόσμιο Πόλεμο.
Όταν πέθανε ο Συναδινός, το 1919, τον διαδέχθηκε στην προεδρία ο Μιχαήλ Σαλβάγος, γιος του Κωνσταντίνου. Η προεδρία του διήρκεσε 29 χρόνια, η μακροβιότερη μέχρι σήμερα προεδρία. Ο Μιχαήλ Σαλβάγος παραμένει ένας από τους σημαντικότερους και δημιουργικότερους προέδρους της Ε.Κ.Α. Επί της προεδρίας του ανακαινίστηκαν τα γραφεία της Ε.Κ.Α. και κτίστηκε η «Φαμηλιάδειος Κοινοτική Σχολή» για να εξυπηρετεί τα ελληνόπουλα της περιοχής του «Attarin» και του κεντρικού σιδηροδρομικού σταθμού, του σταθμού του Καΐρου όπως ονομάζεται. Το 1925, με δωρεά του Αντώνη Αντωνιάδη, ιδρύθηκε το Γηροκομείο. Ο πατέρας του Sir Ιωάννης Αντωνιάδης, υπήρξε ο δωρητής που χάρισε στο Δήμο Αλεξανδρείας το οικογενειακό του αρχοντικό με τους ονομαστούς κήπους του για την αναψυχή των Αλεξανδρινών. Στο οικόπεδο στεγάζονται σήμερα ο Ζωολογικός και ο Βοτανικός κήπος.
Επί της προεδρίας του και με τη συνδρομή και βοήθεια της οικογένειας Κότσικα, κτίστηκε το πολυώροφο, υπερσύγχρονο και άριστα εξοπλισμένο νοσοκομείο. Η Ε.Κ.Α. ανέλαβε την διαχείριση του νοσοκομείου, το οποίο εγκαινιάστηκε το 1938. Το Κοτσίκειο διαδραμάτισε σπουδαίο ρόλο κατά τον Δεύτερο Παγκόσμιο Πόλεμο όταν στην Αίγυπτο κατέφυγαν ο ελληνικός στρατός και η εξόριστη ελληνική κυβέρνηση, εξαιτίας της γερμανικής κατοχής στην Ελλάδα. Στη διάρκεια του πολέμου, το διακοσίων πενήντα (250) κλινών νοσοκομείο νοσήλευσε τραυματίες Έλληνες, Αιγυπτίους και συμμάχους. Το νοσοκομείο πωλήθηκε από την ελληνική κυβέρνηση στην αιγυπτιακή το 1964. Επί Σαλβάγου, η Ε.Κ.Α. έζησε ακόμη μία λαμπρή εποχή. Μετά τον θάνατό του άρχισε η συρρίκνωση, καθώς οι καινούριες πολιτικοοικονομικές συνθήκες που επικράτησαν στη χώρα λειτούργησαν αρνητικά με τους νέους νόμους εργασίας για τους ξένους, την αναδιανομή της καλλιεργήσιμης γης και την κρατικοποίηση των μεγάλων ιδιωτικών επιχειρήσεων. Η παροικία άρχισε να φυλλορροεί. Το μεγαλύτερο τμήμα της επέστρεψε στην Ελλάδα, ενώ οι υπόλοιποι πήραν το δρόμο μιας δεύτερης μετανάστευσης σε άλλες χώρες (κυρίως στη Νότιο Αφρική και την Αυστραλία).